تنوع ژنتیکی hordei Ustilago عامل بیماری سیاهک پنهان جو در استان خوزستان با استفاده از نشانگرهای رپید

بیماری سیاهک پنهان جو توسط قارچ Ustilago hordei (Pers.) Lagerh.، ایجاد می‌شود. این بیماری باعث کاهش محصول در واحد سطح شده و یکی از عوامل محدود کننده تولید جو در ایران به شمار می‌رود. در سال زراعی 88- 1387، 144 جدایه U. hordei از 36 منطقه کشت‌و‌کار جو در استان جمع‌آوری شد و تنوع ژنتیکی 100 جدایه با نشانگر مولکولی رپید بررسی شد. از میان 14 آغازگر استفاده شده، چهار آغازگر بر اساس تکثیر موفقیت آمیز، تکرارپذیری و تولید قطعات چندشکلی دی.ان.ا انتخاب شدند. چهار آغازگر رپید در مجموع توانستند 71 لوکوس با قابلیت امتیاز دهی را شناسایی و تکثیر کنند که 73/88 درصد آن‌ها (63 لوکوس) چند‌شکل بودند. بیشترین چند‌شکلی توسط آغازگرOPA 04  (19 لوکوس) و کمترین چند‌شکلی توسط آغازگر OPA 10 (11 لوکوس) حاصل شد. بالاترین مقدار PIC مربوط به آغازگرOPA 18 معادل 33/0 و کمترین آن مربوط به آغازگرهای OPA 03 و  OPA 10برابر 29/0 بود. از میان آغازگرهای استفاده شده، آغازگرهای OPA 04 و OPA 18 که مقدار MI بالاتری را به خود اختصاص دادند،می‌توانند برای مطالعه جدایه‌های U. hordei با استفاده ازنشانگر رپید در سطح وسیع بکار گرفته شوند. تجزیه خوشه‌ای الگوهای باندی حاصل از مجموع چهار آغازگر با استفاده از روش یو.پی.جی.ام.ا و ضریب تشابه جاکارد، در سطح تشابه 66 درصد جدایه‌ها را در 11 گروه انگشت نگاری قرار داد. این پژوهش، اولین مطالعه تنوع ژنتیکی جدایه‌های U. hordei با استفاده از نشانگرهای مولکولی می‌باشد.